Centre de Pharmacogénomique Beaulieu-Saucier à l’Institut de Cardiologie de Montréal

Nom de l’entité

Centre de Pharmacogénomique Beaulieu-Saucier à l'Institut de Cardiologie de Montréal

Type d’entité

Plateforme

Mots clés

Laboratoire accrédité CAP/CLIA, Extraction ADN, Biobank, Génotypage, séquençage, protéomique (Olink), Bioinformatiques et Statistiques

Domaines d’expertises

Expertise en extraction ADN, génomique, biostatistiques, bio-informatique, biobanquage, études cliniques

Services offerts

1- Gestion projets cliniques:
– Développement de protocoles de collecte de spécimens cliniques (Sang, Buccal Swab, Salive, Plasma, Sérum, Tasso)
– Assister les équipes cliniques avec la logistique de collecte de spécimens

2-Extraction ADN et ARN:
– Extraction ADN avec techniques automatisées (QIAsymphony et FlexStarPlus)
– Extraction ADN à partir du sang entier, Buccal Swab, Salive et Tasso
– Extraction ARN à partir de PAXGen RNA.

3- Biobanking
– Entreposage des spécimens cliniques (ADN, ARN, Plasma, Serum) à -20/80°C dans un environnement validé/contrôlé

4- Génotypage
– Génotypage Pan-Génomique avec technologie Illumina Infinium
– Analyse des pharmacogènes (CYP2D6 etc.)
– Analyse PRS (Risques polygéniques)
– Analyse de panels génétiques ciblés avec technique iplex MassArray

5- Séquençage
– Séquençage ciblé des gènes CHIP (3000X CleanPlex-UMI)
– Séquençage génome humain entier 30-50x et low pass 2-4x (Illumina DNA PCR-Free/NovaSeq X)

6- Bioinformatiques/Statistique Génétique
– Analyses génétiques (GWAS, PRS, séquençage)
– Analyses protéomiques OLINK
– Analyses sur bases de données cliniques (Biobanque de l’ICM, UK – Biobank, All of Us, CLSA-ELCV, CARTaGENE)
– Construction de base de données et questionnaires de recherche sur RedCap

Responsable

Ian Mongrain
ian.mongrain@pharmacogenomics.ca
(514) 770-3667
http://pharmacogenomics.ca

Adresse

Adresse complète : Beaulieu-Saucier Université de Montréal Pharmacogenomics Centre
5000 East Belanger Street
Montreal, Quebec H1T 1C8